Arima Genomics完成客户验证并上市Arima-HiChIP试剂盒和服务
2020-03-17 15:23:08来源:互联网

圣迭戈--(美国贸易资讯)--Arima Genomics, Inc.是一家专注于加快基因组构造信息在医学研究、诊断和治疗中应用的生物技巧公司,该公司今天宣布,基于其现有Arima-HiC平台打造的HiChIP应用已周全上市。跟着此次上市,研究人员如今能经由过程单次实验获得在感兴趣的蛋白质占据的基因组位点上特别丰富的长距离染色质互相感化,从而能加快发明和揭橥速度并降低成本。

此次上市代表已完成成功的市场开辟和Beta测试项目,从而衍生出市场需求的进一步证据、凭借进级品德控制晋升产品机能,并供给来自客户验证的宝贵反馈。Mayo Clinic心理学传授Tamas Ordog表示:“我们对经由Arima HiChIP筹划获得的数据认为异常知足。”关键看法领袖、凯斯西储大年夜学(Case Western University)传授、Case综合癌症中间成员Peter Scacheri表示:“成果显示出很高的可反复性和出色的整体品德,该试剂盒节俭了时光和测序成本。我们特别看重直截了当的品德控制步调和易用性,总体而言,Arima HiChIP具有巨大年夜价值。我们对Arima-HiChIP数据的信息性质和品德认为知足。”

HiChIP数据能为基因调控的机制基本及其若何最终导致疾病状况供给信息。Sanford Burnham Prebys长老会医学发明研究所发育、衰老和再生项目传授Lorenzo Puri表示:“经由过程H3K27ac或H3K4me4 HiChIP丰富的活泼染色质功能,我们发清楚明了高分辨率的染色质环化事宜,这些事宜在健康状况、衰老或肌肉养分不良等疾病的肌肉再生过程中,可促进肌肉干细胞从静止状况过渡到其致力于分化成再生肌纤维的过程中的基因控制。”

早期客户产生的反馈和数据也有助于懂得HiChIP在相干分析(例如HiC和ChIP-Seq)背景中的定位。特别是,尽管HiC可反应基因组组织的全局框架,但HiChIP可丰富来源于研究感兴趣的特定基因组位点的目标染色质互相感化。根据研究的请求,研究人员能发挥全方位HiC、更高分辨率的HiChIP或两者的优势。Puri弥补道:“HiChIP数据与我们全基因组HiC数据的汇总分析,对于懂得影响基因调控的更广泛的区室化和拓扑框架以及特定顺式调控要素之间更精细的分辨率接洽至关重要。”

重要的是,因为来自HiChIP的染色质互相感化数据以三维方法反应了基因组的固有折叠(和缺点折叠),是以这也可认为从新分列的癌症染色体上的基因调节缺点供给信息,这是传统ChIP-Seq实验所缺乏的重要看法。Scacheri弥补道: “我们不仅不雅察到跨癌症基因组的染色体内顺式调控互相感化,并且还不雅察到重排染色体上染色体间的异位顺式调控互相感化。我们认为,该数据将有助于更好地勾画癌症中基因与表不雅基因驱动子事宜之间的关系。”

科学界熟悉到HiChIP的价值,在缺乏经贸易验证的试剂盒的情况下,一向在克己这种生物化学。研究神经精力病学遗传学的加州大年夜学旧金山分校助理传授Yin Shen表示:“我们一向在克己HiChIP,因为它可供给既往分别进行HiC和ChIP-Seq实验所获得的关键看法。在最具挑衅性的终末分化神经元样本中,我们的克己版本之前掉败了,即便应用此类样本,Arima-HiChIP仍可生成卓越的数据品德和可反复性,是以为我们节俭了可不雅的反复成本。”

为了响应客户对数据分析的需求,该公司与学术合作伙伴合作,以优化经学界验证的开源生物信息学对象,例如MAPS。Arima MAPS产品管线可主动输出易于懂得的品德控制统计数据,并在用户按下按钮后持续生成染色质互相感化热图和弧形图,以便在基因组浏览器中轻松查看。除了简化的数据分析之外,该公司还专注于加强客户办事和支撑体验,这是其为加快样本至发明和揭橥工作而赓续尽力的一部分。Ordog弥补道:“Arima技巧支撑团队异常出色。”

该公司在其现有Arima-HiC平台上开辟了HiChIP,旨在经由过程一个通用Arima试剂盒同时支撑HiC和HiChIP。此外,该公司扩大年夜了营业范围,并加强了其贸易团队,以便向全球发售这些试剂盒。Arima Genomics贸易总监Joseph Spidle表示:“经客户验证的Arima-HiChIP试剂盒和办事的上市标记住一个重要里程碑,因为它既可以实现目标HiC办法的贸易化,又是对传统ChIP-Seq的进级。我们的目标是在实现基因组构造看法可用性平易近主化的同时,向Arima-HiC平台添加有临床意义和科学意义的应用,以加快基本研究和疾病相干研究。”

Arima Genomics, Inc.是一家生物技巧公司,其目标是促进对基因组次序和构造及其对健康、疾病、物种演变感化的懂得。欲懂得进一步信息,请拜访:http://www.arimagenomics.com。

原文版本可在businesswire.com上查阅:https://www.businesswire.com/news/home/20200316005137/en/

关于Arima Genomics

免责声明:本通知布告之原文版本乃官方授权版本。译文仅供便利懂得之用,烦请参照原文,原文版本乃独一具司法效力之版本。

接洽方法:

Siddarth Selvaraj
首席履行官,Arima Genomics
sid@arimagenomics.com

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